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          病同不良和功治症增生制网络能性讨逍乳腺学探消化的作基于药理遥散异抑郁用机三

          时间:2010-12-5 17:23:32  作者:百科   来源:热点  查看:  评论:0
          内容摘要:2.3 关键靶点的查找以及关键活性成分的查找把38个共有靶点导入STRING数据库,并设置interaction score>0.9,构建PPI网络。PPI网络包含35个靶点以及121条边图3A

          2.3 关键靶点的异病同治查找以及关键活性成分的查找

          把38个共有靶点导入STRING数据库,并设置interaction score>0.9,基于机制构建PPI网络。网络PPI网络包含35个靶点以及121条边(图3A)。药理遥散抑郁利用Cytoscape 3.7.1软件的学探腺增性消MCODE插件对该网络进行聚类分析,共得到3个子网络。讨逍根据得分最高创建核心靶点网络图(图3B)。症乳作用核心靶标网络(得分8.222)中的生和节点有:IL-6、IL-4、异病同治TNF、基于机制IL-1A、网络ICAM1、药理遥散抑郁CCL2、学探腺增性消CXCL8、讨逍IL-1B、症乳作用IL-10和IFNG。

          根据“单味药-活性成分-共同靶点”相互作用网络筛选得到的关键靶点搜寻到相应的8个关键活性成分:槲皮素(MOL000098)、山柰酚(MOL000422)、β-谷固醇(MOL000358)、芦荟大黄素(MOL000471)、Glyasperins M(MOL000354)、刺芒柄花素(MOL000392)、金合欢素(MOL001689)和柚皮素(M OL004328)。

          2.4 通路分析

          将上述获得的逍遥散治疗抑郁症、乳腺增生和功能性消化不良的共同靶点输入Metascape数据库进行KEGG通路注释分析。根据P<0.05对KEGG通路结果进行筛选,共得到17条相关通路,其中包括糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路 (AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications)、HIF-1信号通路 (HIF-1 signaling pathway)以及癌症通路 (pathways in cancer)等通路(图4A)。GO富集结果表明,在生物过程(biological process)中,逍遥散对脂多糖(response to lipopolysaccharide)、活性氧代谢 (reactive oxygen species metabolic process)以及细胞因子介导的通路 (cytokine-mediated signaling pathway)等的影响较大;在分子功能(molecular function)层面上,逍遥散对细胞因子 (cytokine receptor binding)、磷酸酶 (phosphatase binding)以及血红素(heme binding)等的影响较大;在细胞组分(cellular component)中,逍遥散对膜筏 (membrane raft)、囊泡(vesicle lumen)以及核包膜 (nuclear envelope)的影响较大(图4B)。

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